Стала известна предварительная причина выезда самолёта за пределы ВПП в Пулково

Пытались сесть с превышением по скорости? А почему не против ветра садились?

Как вообще можно до сих пор летать на ЯК-40? Ветер видимо пытался сдуть его на свалку до того как он рухнет вместе с людьми на борту.

Хотели красиво войти в поворот на рулёжку, да ветром сдуло...

Я думаю, здесь сработал эффект экрана, усиленный порывистым ветром. Это, когда у самой земли возникает избыточная подъёмная сила, мешающая прижать машину к земле. Из-за этого и мог случиться "перелёт".

значительно интересней, откуда в самолёте взялись 3 лишних члена экипажа...

Як-40 небольшой самолет, ему эта полоса с полуторным запасом. Либо сел не в начале, либо реальная скорость превышена, либо реверс поздно включил, а садиться можно и против ветра, только надо уметь.
Смешно, но много лп происходит на облетах и технических рейсах. Спиртом салон дезинфицируют.

Ну как не отразилась на работе аэропорта: вместо 21-10 только в 21-40 взлетел. Очередь из самолетов на взлёт была...