Очень похоже на подставу. Учебное заведение успешно занимается образовательной деятельностью на коммерческой основе. Возможно именно с этим связано все проишедшее. На это же подозрение наводит мера пресечения. Без руководителя у организации явно возникнут сложности в работе, в том числе в подписании банковских документов.